История футбольного клуба "Обнинск" началась в 1990 году с команды по мини-футболу, которая называлась "Сигнал". Команда выступала очень успешно и два года подряд становилась победителем Чемпионата СССР. В 1992 году команда поменяла свою направленность на большой футбол, получила новое название, ФК "Обнинск", и начала выступать среди коллективов физической культуры (КФК). Команда показала блестящий результат, выиграв первенство в своей зоне за один год, а на первенстве России среди любительских команд стаала серебряным призером. Уже с 1993 года ФК "Обнинск" выступал в профессиональном футболе под начальством главного тренера Юрия Рубеновича Карамяна и занял четвертое место. В 1994 году клуб поменял свое название на "Индустрия" (Обнинск) и не очень удачно выступил во втором дивизионе. В следующем году команда поменяла место прописки на Боровск и более успешно выступила в своей зоне. В 1996 году "Индустрия" оказалась на последнем месте в зоне Центр и попала в третью лигу, где также заняла одно из последних мест. В 1997 году на тренерском мостике появился Валерий Андреевич Ткачук, который остался в команде до 2003 года. За время своих выступлений в профессионалах команда не делала ставку на розыгрыш Кубка России и никогда не продвигалась дальше 1/128 финала. В 1998-2000 годах команда по финансовым причинам не участвовала в соревнованиях. В 2001 году началось покорение вершин любительского футбола. Но снова переименованный в ФК "Обнинск" клуб занял место в середине таблицы. В 2002 году команда заняла уже второе место и участвовала в финале Кубка МФФ "Золотое Кольцо". 2003 год можно назвать триумфом ФК "Обнинск" в любительском футболе. Команда стала победителем зоны "Золотое Кольцо", выиграла Кубок этой зоны, что позволило ей участвовать в финальной части розыгрыша Кубка России среди любительских команд, который прошел в Обнинске. Команда вышла в финал розыгрыша этого Кубка, где уверенно победила московский «Алмаз» со счетом 3:1. А на первенстве России среди любительских команд в городе Азов заняла второе место после выступавшей «вне конкурса» команды из Нарткалы. Таким успехом команда обязана приходу в команду известного игрока и главного тренера Дмитрия Вячеславовича Быстрова. В межсезонье 2003/04 команда поучаствовала в нескольких зимних турнирах вместе с командами второго дивизиона, где неплохо и боеспособно показала себя. Сезон 2004 начался с поражения в Кубке России. Дебютант в профессиональном футболе подмосковная «Лобня-Алла» победила ФК «Обнинск» со счетом 2:0, но обнинцы не сильно расстроились, потому что успехов в Кубке России они не планировали.
* 1992 — 1 место в зоне «Центр» КФК * 1993 — 4 место во второй лиге, зона 6 * 1994 — 16 место в первой лиге, зона «Центр» * 1996 — 17 место в третьей лиге, зона 3 * 2001 — 5 место в зоне «Золотое Кольцо» КФК * 2002 — 2 место в зоне «Золотое Кольцо» КФК * 2003 — 2 место в зоне «Золотое Кольцо» КФК * 2004 — 13 место во втором дивизионе, зона «Центр» * 2005 — снялся с соревнований 24 января